Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bop1P97452 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bop1P97452 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bop1P97452 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bop1P97452 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bop1P97452 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bop1P97452 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bop1P97452 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bop1P97452 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bop1P97452 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Bop1P97452 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bop1P97452 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bop1P97452 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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