Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nbr1P97432 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms