Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irx1P81068 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Irx1P81068 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx1P81068 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx1P81068 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Irx1P81068 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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