Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ldb1P70662 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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