Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NficP70255 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NficP70255 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NficP70255 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NficP70255 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NficP70255 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NficP70255 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NficP70255 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NficP70255 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NficP70255 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NficP70255 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NficP70255 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NficP70255 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NficP70255 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NficP70255 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NficP70255 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NficP70255 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NficP70255 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NficP70255 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NficP70255 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NficP70255 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NficP70255 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NficP70255 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NficP70255 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NficP70255 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NficP70255 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NficP70255 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NficP70255 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NficP70255 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NficP70255 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NficP70255 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NficP70255 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NficP70255 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NficP70255 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NficP70255 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NficP70255 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NficP70255 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NficP70255 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NficP70255 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NficP70255 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NficP70255 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NficP70255 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NficP70255 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NficP70255 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NficP70255 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NficP70255 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NficP70255 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NficP70255 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NficP70255 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NficP70255 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NficP70255 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NficP70255 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NficP70255 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NficP70255 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NficP70255 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NficP70255 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NficP70255 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NficP70255 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NficP70255 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NficP70255 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NficP70255 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NficP70255 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NficP70255 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NficP70255 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NficP70255 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NficP70255 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NficP70255 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NficP70255 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NficP70255 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NficP70255 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NficP70255 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NficP70255 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NficP70255 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NficP70255 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NficP70255 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NficP70255 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NficP70255 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NficP70255 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NficP70255 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NficP70255 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NficP70255 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NficP70255 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NficP70255 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NficP70255 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NficP70255 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NficP70255 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NficP70255 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NficP70255 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NficP70255 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NficP70255 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NficP70255 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NficP70255 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NficP70255 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NficP70255 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NficP70255 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NficP70255 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NficP70255 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NficP70255 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NficP70255 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NficP70255 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms