Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxd13P70217 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms