Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrkcbP68404 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcbP68404 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms