Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vsnl1P62761 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsnl1P62761 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms