Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpfP62307 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms