Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Setd4P58467 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Setd4P58467 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Setd4P58467 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Setd4P58467 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Setd4P58467 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Setd4P58467 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Setd4P58467 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Setd4P58467 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Setd4P58467 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Setd4P58467 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Setd4P58467 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms