Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samsn1P57725 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms