Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FmodP50608 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FmodP50608 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FmodP50608 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FmodP50608 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FmodP50608 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FmodP50608 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FmodP50608 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FmodP50608 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
FmodP50608 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FmodP50608 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FmodP50608 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FmodP50608 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FmodP50608 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FmodP50608 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FmodP50608 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FmodP50608 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FmodP50608 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FmodP50608 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
FmodP50608 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FmodP50608 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FmodP50608 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FmodP50608 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FmodP50608 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FmodP50608 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FmodP50608 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
FmodP50608 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
FmodP50608 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FmodP50608 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FmodP50608 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FmodP50608 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FmodP50608 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
FmodP50608 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FmodP50608 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FmodP50608 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FmodP50608 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FmodP50608 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
FmodP50608 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
FmodP50608 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FmodP50608 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FmodP50608 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FmodP50608 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FmodP50608 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FmodP50608 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FmodP50608 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FmodP50608 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FmodP50608 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FmodP50608 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FmodP50608 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FmodP50608 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FmodP50608 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FmodP50608 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FmodP50608 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FmodP50608 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FmodP50608 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FmodP50608 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FmodP50608 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FmodP50608 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FmodP50608 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FmodP50608 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
FmodP50608 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FmodP50608 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
FmodP50608 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FmodP50608 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FmodP50608 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FmodP50608 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FmodP50608 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FmodP50608 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FmodP50608 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FmodP50608 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FmodP50608 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FmodP50608 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FmodP50608 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FmodP50608 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FmodP50608 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FmodP50608 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FmodP50608 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FmodP50608 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FmodP50608 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FmodP50608 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FmodP50608 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FmodP50608 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FmodP50608 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FmodP50608 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FmodP50608 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FmodP50608 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FmodP50608 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FmodP50608 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FmodP50608 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FmodP50608 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FmodP50608 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FmodP50608 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FmodP50608 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FmodP50608 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FmodP50608 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FmodP50608 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FmodP50608 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FmodP50608 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FmodP50608 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FmodP50608 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms