Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CitP49025 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CitP49025 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CitP49025 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CitP49025 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CitP49025 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CitP49025 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CitP49025 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CitP49025 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CitP49025 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CitP49025 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CitP49025 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CitP49025 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CitP49025 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CitP49025 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CitP49025 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CitP49025 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CitP49025 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CitP49025 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CitP49025 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CitP49025 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CitP49025 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CitP49025 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CitP49025 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CitP49025 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CitP49025 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CitP49025 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CitP49025 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CitP49025 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CitP49025 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CitP49025 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CitP49025 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CitP49025 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CitP49025 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CitP49025 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CitP49025 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CitP49025 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CitP49025 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CitP49025 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CitP49025 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CitP49025 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CitP49025 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CitP49025 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CitP49025 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CitP49025 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CitP49025 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CitP49025 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CitP49025 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CitP49025 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CitP49025 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CitP49025 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CitP49025 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CitP49025 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CitP49025 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CitP49025 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CitP49025 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CitP49025 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CitP49025 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CitP49025 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CitP49025 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CitP49025 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CitP49025 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CitP49025 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CitP49025 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CitP49025 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CitP49025 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CitP49025 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CitP49025 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CitP49025 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CitP49025 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CitP49025 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CitP49025 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CitP49025 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CitP49025 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CitP49025 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CitP49025 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CitP49025 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CitP49025 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CitP49025 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CitP49025 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CitP49025 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CitP49025 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CitP49025 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CitP49025 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CitP49025 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CitP49025 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CitP49025 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CitP49025 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CitP49025 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CitP49025 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CitP49025 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CitP49025 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CitP49025 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CitP49025 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CitP49025 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CitP49025 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CitP49025 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CitP49025 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CitP49025 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CitP49025 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms