Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd1P48410 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms