Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rfx2P48379 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rfx2P48379 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rfx2P48379 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rfx2P48379 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx2P48379 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms