Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VhlP40338 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VhlP40338 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VhlP40338 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VhlP40338 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
VhlP40338 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VhlP40338 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VhlP40338 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VhlP40338 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VhlP40338 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VhlP40338 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VhlP40338 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
VhlP40338 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
VhlP40338 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
VhlP40338 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VhlP40338 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VhlP40338 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VhlP40338 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VhlP40338 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VhlP40338 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VhlP40338 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VhlP40338 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VhlP40338 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VhlP40338 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VhlP40338 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VhlP40338 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VhlP40338 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VhlP40338 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VhlP40338 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VhlP40338 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
VhlP40338 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VhlP40338 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VhlP40338 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
VhlP40338 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VhlP40338 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VhlP40338 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VhlP40338 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VhlP40338 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
VhlP40338 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VhlP40338 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VhlP40338 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VhlP40338 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VhlP40338 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VhlP40338 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VhlP40338 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VhlP40338 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VhlP40338 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VhlP40338 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VhlP40338 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VhlP40338 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VhlP40338 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VhlP40338 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VhlP40338 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VhlP40338 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VhlP40338 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VhlP40338 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VhlP40338 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VhlP40338 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VhlP40338 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VhlP40338 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VhlP40338 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VhlP40338 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VhlP40338 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
VhlP40338 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VhlP40338 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VhlP40338 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VhlP40338 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
VhlP40338 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VhlP40338 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VhlP40338 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VhlP40338 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VhlP40338 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VhlP40338 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VhlP40338 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VhlP40338 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VhlP40338 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VhlP40338 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VhlP40338 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VhlP40338 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VhlP40338 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VhlP40338 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VhlP40338 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VhlP40338 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VhlP40338 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VhlP40338 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VhlP40338 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VhlP40338 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VhlP40338 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VhlP40338 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VhlP40338 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VhlP40338 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VhlP40338 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VhlP40338 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VhlP40338 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VhlP40338 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VhlP40338 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VhlP40338 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VhlP40338 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VhlP40338 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VhlP40338 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms