Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddit3P35639 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms