Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcdP28867 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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