Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atxn10P28658 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atxn10P28658 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atxn10P28658 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atxn10P28658 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atxn10P28658 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atxn10P28658 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atxn10P28658 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atxn10P28658 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atxn10P28658 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atxn10P28658 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn10P28658 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms