Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctnna1P26231 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms