Protein–RNA interactions for Protein: P25976

Ubtf, Nucleolar transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbtfP25976 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UbtfP25976 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UbtfP25976 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UbtfP25976 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UbtfP25976 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UbtfP25976 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UbtfP25976 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UbtfP25976 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UbtfP25976 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UbtfP25976 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UbtfP25976 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UbtfP25976 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UbtfP25976 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UbtfP25976 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UbtfP25976 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UbtfP25976 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UbtfP25976 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UbtfP25976 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UbtfP25976 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UbtfP25976 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UbtfP25976 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UbtfP25976 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UbtfP25976 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UbtfP25976 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UbtfP25976 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms