Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eif3aP23116 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eif3aP23116 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eif3aP23116 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eif3aP23116 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eif3aP23116 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eif3aP23116 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Eif3aP23116 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eif3aP23116 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eif3aP23116 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eif3aP23116 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Eif3aP23116 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eif3aP23116 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eif3aP23116 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eif3aP23116 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eif3aP23116 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eif3aP23116 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eif3aP23116 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eif3aP23116 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eif3aP23116 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eif3aP23116 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eif3aP23116 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eif3aP23116 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eif3aP23116 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eif3aP23116 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eif3aP23116 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eif3aP23116 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eif3aP23116 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eif3aP23116 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eif3aP23116 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Eif3aP23116 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eif3aP23116 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eif3aP23116 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eif3aP23116 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eif3aP23116 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eif3aP23116 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eif3aP23116 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eif3aP23116 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Eif3aP23116 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3aP23116 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms