Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm3P21107 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tpm3P21107 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tpm3P21107 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3P21107 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3P21107 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3P21107 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3P21107 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3P21107 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3P21107 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3P21107 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3P21107 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3P21107 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3P21107 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3P21107 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3P21107 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3P21107 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3P21107 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3P21107 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3P21107 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3P21107 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3P21107 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3P21107 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3P21107 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3P21107 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3P21107 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3P21107 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3P21107 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3P21107 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3P21107 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3P21107 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3P21107 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3P21107 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3P21107 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm3P21107 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm3P21107 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm3P21107 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm3P21107 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm3P21107 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm3P21107 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm3P21107 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm3P21107 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm3P21107 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm3P21107 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm3P21107 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm3P21107 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm3P21107 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms