Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RargP18911 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RargP18911 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RargP18911 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RargP18911 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RargP18911 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RargP18911 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RargP18911 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RargP18911 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RargP18911 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RargP18911 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RargP18911 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RargP18911 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RargP18911 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RargP18911 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RargP18911 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RargP18911 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RargP18911 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RargP18911 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RargP18911 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RargP18911 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RargP18911 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RargP18911 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RargP18911 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RargP18911 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RargP18911 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RargP18911 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RargP18911 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RargP18911 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RargP18911 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RargP18911 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RargP18911 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RargP18911 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RargP18911 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RargP18911 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RargP18911 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RargP18911 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RargP18911 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RargP18911 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RargP18911 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RargP18911 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RargP18911 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RargP18911 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RargP18911 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RargP18911 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RargP18911 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RargP18911 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RargP18911 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RargP18911 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RargP18911 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RargP18911 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RargP18911 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RargP18911 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RargP18911 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RargP18911 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RargP18911 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RargP18911 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RargP18911 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RargP18911 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RargP18911 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RargP18911 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RargP18911 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RargP18911 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RargP18911 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RargP18911 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RargP18911 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RargP18911 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RargP18911 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RargP18911 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RargP18911 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RargP18911 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RargP18911 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RargP18911 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RargP18911 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RargP18911 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RargP18911 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RargP18911 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RargP18911 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RargP18911 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RargP18911 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RargP18911 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RargP18911 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RargP18911 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RargP18911 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RargP18911 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RargP18911 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RargP18911 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RargP18911 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RargP18911 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RargP18911 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RargP18911 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RargP18911 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RargP18911 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RargP18911 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RargP18911 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RargP18911 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RargP18911 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RargP18911 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RargP18911 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RargP18911 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms