Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxb1P17919 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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