Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Amd1P0DMN7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms