Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Spta1P08032 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spta1P08032 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms