Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfrbP05622 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfrbP05622 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfrbP05622 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrbP05622 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrbP05622 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrbP05622 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrbP05622 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrbP05622 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrbP05622 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PdgfrbP05622 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfrbP05622 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms