Protein–RNA interactions for Protein: P01672

Ig kappa chain V-III region PC 7940, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01672 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01672 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P01672 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01672 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01672 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01672 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01672 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01672 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01672 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01672 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01672 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P01672 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01672 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01672 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01672 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01672 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P01672 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01672 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01672 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01672 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01672 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01672 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01672 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01672 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01672 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01672 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01672 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01672 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01672 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01672 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01672 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01672 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01672 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01672 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01672 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01672 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
P01672 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01672 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01672 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01672 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01672 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01672 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01672 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01672 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01672 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01672 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01672 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01672 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01672 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01672 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01672 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01672 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01672 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01672 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01672 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01672 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01672 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01672 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01672 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01672 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01672 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01672 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01672 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01672 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01672 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01672 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01672 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01672 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01672 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01672 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01672 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01672 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01672 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01672 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01672 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P01672 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01672 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01672 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01672 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01672 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01672 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01672 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01672 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01672 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01672 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01672 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01672 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P01672 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P01672 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01672 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01672 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01672 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01672 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01672 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01672 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01672 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01672 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01672 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01672 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01672 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms