Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dnmt3aO88508 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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