Protein–RNA interactions for Protein: O70401

Tspan6, Tetraspanin-6, mousemouse

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Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tspan6O70401 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tspan6O70401 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tspan6O70401 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tspan6O70401 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tspan6O70401 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Tspan6O70401 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tspan6O70401 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Tspan6O70401 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tspan6O70401 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tspan6O70401 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Tspan6O70401 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Tspan6O70401 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tspan6O70401 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan6O70401 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan6O70401 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan6O70401 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan6O70401 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Tspan6O70401 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan6O70401 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan6O70401 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan6O70401 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan6O70401 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan6O70401 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan6O70401 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan6O70401 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan6O70401 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan6O70401 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan6O70401 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan6O70401 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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