Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms