Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb3O54890 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms