Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NmiO35309 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NmiO35309 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NmiO35309 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NmiO35309 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NmiO35309 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NmiO35309 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NmiO35309 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NmiO35309 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NmiO35309 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NmiO35309 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NmiO35309 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NmiO35309 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NmiO35309 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NmiO35309 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NmiO35309 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NmiO35309 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NmiO35309 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NmiO35309 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NmiO35309 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NmiO35309 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NmiO35309 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NmiO35309 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NmiO35309 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NmiO35309 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NmiO35309 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NmiO35309 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NmiO35309 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NmiO35309 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NmiO35309 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NmiO35309 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NmiO35309 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NmiO35309 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NmiO35309 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NmiO35309 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NmiO35309 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NmiO35309 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NmiO35309 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NmiO35309 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NmiO35309 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NmiO35309 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NmiO35309 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NmiO35309 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NmiO35309 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NmiO35309 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NmiO35309 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NmiO35309 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NmiO35309 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NmiO35309 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NmiO35309 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NmiO35309 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NmiO35309 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NmiO35309 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NmiO35309 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NmiO35309 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NmiO35309 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NmiO35309 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NmiO35309 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NmiO35309 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NmiO35309 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NmiO35309 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NmiO35309 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NmiO35309 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NmiO35309 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NmiO35309 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NmiO35309 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NmiO35309 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NmiO35309 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NmiO35309 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NmiO35309 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NmiO35309 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NmiO35309 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NmiO35309 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NmiO35309 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NmiO35309 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NmiO35309 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NmiO35309 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NmiO35309 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NmiO35309 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NmiO35309 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NmiO35309 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NmiO35309 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NmiO35309 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NmiO35309 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NmiO35309 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NmiO35309 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NmiO35309 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NmiO35309 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NmiO35309 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NmiO35309 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NmiO35309 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NmiO35309 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NmiO35309 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NmiO35309 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NmiO35309 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NmiO35309 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NmiO35309 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NmiO35309 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NmiO35309 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NmiO35309 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms