Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ArxO35085 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ArxO35085 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ArxO35085 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ArxO35085 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ArxO35085 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ArxO35085 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ArxO35085 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ArxO35085 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ArxO35085 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ArxO35085 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ArxO35085 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ArxO35085 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ArxO35085 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ArxO35085 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ArxO35085 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ArxO35085 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ArxO35085 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ArxO35085 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ArxO35085 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ArxO35085 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ArxO35085 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ArxO35085 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ArxO35085 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ArxO35085 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ArxO35085 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ArxO35085 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ArxO35085 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ArxO35085 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ArxO35085 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ArxO35085 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ArxO35085 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ArxO35085 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ArxO35085 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ArxO35085 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ArxO35085 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ArxO35085 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ArxO35085 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ArxO35085 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ArxO35085 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ArxO35085 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ArxO35085 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ArxO35085 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ArxO35085 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ArxO35085 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ArxO35085 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ArxO35085 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ArxO35085 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ArxO35085 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ArxO35085 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ArxO35085 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ArxO35085 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ArxO35085 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ArxO35085 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ArxO35085 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ArxO35085 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ArxO35085 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ArxO35085 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ArxO35085 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ArxO35085 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ArxO35085 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ArxO35085 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ArxO35085 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ArxO35085 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ArxO35085 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ArxO35085 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ArxO35085 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ArxO35085 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ArxO35085 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ArxO35085 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ArxO35085 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ArxO35085 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ArxO35085 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ArxO35085 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ArxO35085 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ArxO35085 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ArxO35085 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ArxO35085 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ArxO35085 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ArxO35085 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ArxO35085 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ArxO35085 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ArxO35085 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ArxO35085 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ArxO35085 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ArxO35085 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ArxO35085 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ArxO35085 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ArxO35085 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ArxO35085 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ArxO35085 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ArxO35085 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ArxO35085 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ArxO35085 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ArxO35085 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ArxO35085 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ArxO35085 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ArxO35085 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ArxO35085 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ArxO35085 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms