Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snap23O09044 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snap23O09044 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap23O09044 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snap23O09044 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snap23O09044 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snap23O09044 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms