Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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