Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

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Length 274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccer2J3QPU5 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms