Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Vmn1r39G3UWE6 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r39G3UWE6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms