Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms