Protein–RNA interactions for Protein: F6TVX7

Gm20671, Predicted gene 20671 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20671F6TVX7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Gm20671F6TVX7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20671F6TVX7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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