Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85cE9Q6B2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc85cE9Q6B2 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc85cE9Q6B2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc85cE9Q6B2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc85cE9Q6B2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc85cE9Q6B2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc85cE9Q6B2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc85cE9Q6B2 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc85cE9Q6B2 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc85cE9Q6B2 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms