Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Zfp558E9Q1J0 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Zfp558E9Q1J0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Zfp558E9Q1J0 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Zfp558E9Q1J0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Zfp558E9Q1J0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Zfp558E9Q1J0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zfp558E9Q1J0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Zfp558E9Q1J0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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