Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms