Protein–RNA interactions for Protein: B7ZMY3

A930018M24Rik, RIKEN cDNA A930018M24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A930018M24RikB7ZMY3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A930018M24RikB7ZMY3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A930018M24RikB7ZMY3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A930018M24RikB7ZMY3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A930018M24RikB7ZMY3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A930018M24RikB7ZMY3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A930018M24RikB7ZMY3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A930018M24RikB7ZMY3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A930018M24RikB7ZMY3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A930018M24RikB7ZMY3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A930018M24RikB7ZMY3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
A930018M24RikB7ZMY3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A930018M24RikB7ZMY3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
A930018M24RikB7ZMY3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
A930018M24RikB7ZMY3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A930018M24RikB7ZMY3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A930018M24RikB7ZMY3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A930018M24RikB7ZMY3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A930018M24RikB7ZMY3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A930018M24RikB7ZMY3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A930018M24RikB7ZMY3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms