Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gm5483B2RV77 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5483B2RV77 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5483B2RV77 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5483B2RV77 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5483B2RV77 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5483B2RV77 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gm5483B2RV77 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5483B2RV77 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5483B2RV77 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gm5483B2RV77 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5483B2RV77 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5483B2RV77 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5483B2RV77 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5483B2RV77 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5483B2RV77 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5483B2RV77 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5483B2RV77 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gm5483B2RV77 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5483B2RV77 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5483B2RV77 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5483B2RV77 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5483B2RV77 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5483B2RV77 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5483B2RV77 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5483B2RV77 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5483B2RV77 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5483B2RV77 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5483B2RV77 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5483B2RV77 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Gm5483B2RV77 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Gm5483B2RV77 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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Gm5483B2RV77 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Gm5483B2RV77 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Gm5483B2RV77 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Gm5483B2RV77 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Gm5483B2RV77 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5483B2RV77 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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