Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Prrt4B2RU40 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Prrt4B2RU40 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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