Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms