Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brpf1B2RRD7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms