Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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Grik3B1AS29 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik3B1AS29 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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Grik3B1AS29 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Grik3B1AS29 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Grik3B1AS29 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Grik3B1AS29 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Grik3B1AS29 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Grik3B1AS29 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms